Una de las principales dificultades en los proyectos de digitalización de expedientes médicos son lo variados que pueden ser los documentos a escanear, desde formularios hasta imágenes radiológicas, por lo que es necesario que los escáneres cuenten con la calidad necesaria para obtener imágenes definidas y que éstas puedan generarse en los diferentes formatos legales para integrarlos al Expediente Médico Electrónico.